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新疆军区总医院的特色和优势科室有：

全军临床药理基地

全军计划生育优生优育技术中心

军区机关认定的“名医名科”和重点学科

军区计划生育优生优育技术中心

军区计划生育技术指导中心

军区传染病诊治中心

军区临床检验中心

军区医学情报中心

军区计划生育优生优育技术中心

军区计划生育技术指导中心

军区传染病诊治中心

军区临床检验中心

军区医学情报中心

新疆四七四医院的特色和优势科室有：

眼科

心血管内科

普外科

妇产科

小儿科

皮肤科

口腔科

传染科

影像科

检验科